Thách thức về con người, quy trình và công nghệ được coi là ba khó khăn hàng đầu với Logistics 4.0, theo EPS News. Cụ thể, về yếu tố nhân lực, các thách thức thường liên quan đến việc thiếu tầm nhìn và hiểu biết chung về việc xây dựng hoạt động Logistics 4.0 trong việc áp dụng công nghệ, robot vào các hoạt động chính như vận tải, quản lý kho bãi ... Ngoài ra, về mặt công nghệ, sự phức tạp trong quá trình này nảy sinh từ việc chuyển giao công nghệ mới sang công nghệ cũ và sự hoài nghi